Vyšetřování rizikových nákaz
Přehled možností laboratorní diagnostiky vysoce rizikových agens v ZÚ se sídlem v Ostravě
Agens | Oddělení | Jméno | Telefon | Materiálu v trojitém obalu |
Metody |
---|---|---|---|---|---|
Bacillus anthracis | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | ANO | kultivace, metabolické metody (BA3D),identifikace, konf. izolátu v NRL |
Brucella sp. | bakteriologie a mykologie imunologie a alergologie |
Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 596 200 221 724 043 771 |
kultivace - ANO sérologie - NE |
kultivace, metabolické metody (BA3D), identifikace + ATB, konf. izolátu v NRL, serologie aglutinací |
Burkholderia mallei | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | ANO | kultivace, metabolické metody (BA3D), identifikace + ATB, konf. izolátu v NRL |
Clostridium botulinum | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | ANO | kultivace, identifikace, průkaz genů pro botulotoxiny z izolovaného kmene metodou PCR |
Clostridium difficile | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | NE | průkaz toxinů A,B a GDH imunoenzymaticky, kultivace, identifikace, stanovení citlivosti k ATB, průkaz genů pro toxiny A,B metodou PCR |
Clostridium tetani | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | ANO | kultivace, identifikace |
Coxiella burnetii | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
NE | EIA IgG, IgM, KFR |
Cryptosporidium sp. | parazitologie a lékařská zoologie | RNDr. J. Doležílková | 596 200 162 724 020 306 |
NE | Mikroskopie - barvení dle Miláčka |
Enterohemoragická E.coli | bakteriologie a mykologie | PhDr. Martina Kubaczková | 596 200 356 | NE | kultivace, identifikace + ATB, serotypizace shigatoxinů metodou PCR, průkaz konf. izolátu v NRL |
Francisella tularensis | bakteriologie a mykologie imunologie a alergologie |
Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 596 200 221 724 043 771 |
kultivace - ANO sérologie - NE |
kultivace, metabolické metody (BA3D), identifikace + ATB, serologie aglutinací, konf. izolátu v NRL |
Hantaviry | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
NE | EIA IgG, IgM, Immunoblot IgG, IgM - typizace HTNV, DOBV, PUUV, PCR+sekvenace |
Histoplasma capsulatum | bakteriologie a mykologie | RNDr. S. Dobiášová | 596 200 239 | ANO | mikroskopie, kultivace, identifikace, konf. izolátu v NRL |
Chikungunya virus | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
NE | IFA IgG, IgM, VNT, PCR + sekvenace |
Chlamydia psittaci | parazitologie a lékařská zoologie | RNDr. J. Doležílková | 596 200 326 | NE | Immunoblot IgG, IgA |
Chřipka-nová varianta A/H1N1 | virologie molekulární biologie |
MUDr. H. Zelená, Ph.D. Mgr. J. Mrázek |
596 200 310 606 738 322 596 200 266 774 979 456 |
výtěr z nosohltanu - ANO krev - NE |
PCR, izolace, KFR-protilátky a průkaz antigenu na chřipku A - bez subtypizace |
Japonská encefalitida v. | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
NE | IFA IgG, IgM, KFR, PCR + sekvenace |
Mycobacterium sp. | bakteriologie a mykologie | Mgr. V. Ulmann | 596 200 144 | NE | kultivace, metabolické metody (MGIT, MB/BacT, BIO FM), mikroskopie, citlivost k AT, mol.biol. metody (gen.sondy, NASBA, PCR) |
Rickettsia prowazekii | bakteriologie a mykologie | NE | IF IgG, IgM | ||
Salmonella Typhi | bakteriologie a mykologie | PhDr. Martina Kubaczková | 596 200 356 | NE | kultivace, metabolické metody (BA3D), identifikace + ATB, konf. izolátu v NRL |
Stafylokokové toxiny | bakteriologie a mykologie | Mgr. T. Prokopová | 596 200 425 | NE | průkaz toxinů RPLA |
Vakcinie virus | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
ANO | jen transmisní elektronová mikroskopie (TEM), jinak se v ČR neprovádí |
Variola virus | virologie | MUDr. H. Zelená, Ph.D. | 596 200 310 606 738 322 |
ANO | jen transmisní elektronová mikroskopie (TEM), jinak se v ČR neprovádí |
Vibrio choleare | bakteriologie a mykologie | PhDr. Martina Kubaczková | 596 200 356 | NE | kultivace, identifikace + ATB, konf. izolátu v NRL |
Yersinia pestis | bakteriologie a mykologie | Mgr. Tereza Prokopová | 596 200 425 | ANO | kultivace, metabolické metody (BA3D), identifikace + ATB, konf. izolátu v NRL |
Výtěr z nosohltanu a nosu pro přímý průkaz viru (izolace viru nebo průkaz virové RNA metodou PCR)
- Výtěr z nosohltanu se provede nejlépe ráno nalačno. Pacient by před tím neměl použít kloktadlo ani zubní pastu. Provádí se suchým sterilním dakronovým tamponem na tyčince-držátku z umělé hmoty.
- Pacienta necháme před odběrem zakašlat. Energicky vytřeme, při současné rotaci tamponem, zadní stěnu nosohltanu a patrové oblouky tak, aby se zachytilo co nejvíce zejména buněčného materiálu. Tonzilám se při odběru na virologii vyhneme. Tampon s materiálem vložíme do zkumavky s vychlazeným virologickým odběrovým/transportním médiem. Plastové držátko - horní část tyčinky odlomíme o okraj zkumavky a vyhodíme. U téhož pacienta provedeme i výtěr nosní sliznice, tampon zalomíme do stejné odběrové zkumavky. Zkumavku s oběma tampony pečlivě uzavřeme zátkou.
- Otevřeme druhou odběrovou zkumavku s médiem a provedeme stejným způsobem ještě jednou výtěr z nosohltanu a nosu. Oba tampony zalomíme do druhé zkumavky. Zkumavku pečlivě uzavřeme zátkou. Tím získáme od jednoho pacienta dvě zkumavky s výtěrem, z nichž každá obsahuje 2 tampony.
- Do doby transportu uchováváme v chladničce při 2-8°C. Transport v nádobě s trojitým obalem s chladítkem nebo tajícím ledem (do igelitového sáčku vložíme několik kostek ledu, uzavřeme gumičkou a dáme do nádoby ke zkumavkám s výtěrem).
- Je vhodné také pacientovi odebrat párové vzorky srážlivé krve na vyšetření protilátek proti respiračním virům – 1. vzorek v akutní fázi nákazy, 2. vzorek s odstupem 2-3 týdnů. Krev není nutno transportovat v nádobě s trojitým obalem – jedná se o běžný biologický materiál.
Virologické odběrové/transportní médium
- Zkumavky se zmrazeným virologickým odběrovým/transportním médiem a dakronové tampony na požádání vydá oddělení virologie, tel.: 596 200 316, 311.
- Zkumavky s médiem uchovávat zmrazené. Při -20°C lze uchovávat až 1 rok. Před použitím se obsah zkumavky roztaví a lehce protřepe.
- Vzorky uchovávat a transportovat při 2-8°C. Nezmrazovat!
Nádoba s trojitým obalem
- Určena pro transport biologických vzorků pro diagnostiku vysoce rizikové nákazy.
- Nádoby zašle na vyžádání oddělení virologie, tel.: 596 200 316.
Transport biologických vzorků určených pro diagnostiku vysoce rizikové nákazy
- Vzorek uložit do nádoby s trojitým obalem, označenou POZOR! VYSOCE INFEKČNÍ MATERIÁL.
- Transport do laboratoře do 24 hodin. Vzorky pro virologická, sérologická, mykologická, molekulárně genetická vyšetření, vzorky pro průkaz antigenů při 2-8°C – s chladítkem nebo tajícím ledem. Do igelitového sáčku vložíme několik kostek ledu, uzavřeme gumičkou a dáme do nádoby ke zkumavkám s výtěrem.
- Vzorky na bakteriologické kultivační vyšetření transportujeme při pokojové teplotě s výjimkou moči, kterou transportujeme v chladu.
- Řádně vyplněná žádanka musí být uložena MIMO bezpečně zabalený materiál! Do diagnózy uveďte podezření na vysoce rizikovou infekci (např. infekci pandemickým virem chřipky A/H1N1).
- Zpracování vzorků v laboratořích ZÚ Ostrava na Oddělení molekulární biologie (596 200 241, 266), Oddělení virologie (596 200 316, 311), Oddělení bakteriologie a mykologie (596 200 425, 596 200 425), Oddělení parazitologie a lékařské zoologie (596 200 327, 596 200 162), Oddělení imunologie a alergologie (596 200 266, 596 200 224).
Vysoce riziková agens, jejichž diagnostika se neprovádí v ZÚ se sídlem v Ostravě
Agens | Instituce provádějící diagnostiku mimo ZÚ | Jméno | Telefon | Materiálu v trojitém obalu |
|
---|---|---|---|---|---|
Ebola virus | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | ANO | neprovádí se v ČR |
Herpes virus simiae | Erasmus MC Rotterdam, Dpt. of Virology, Nizozemsko | dr. Martin Schutten | + 31 104 634 363 | ANO | neprovádí se v ČR |
Horečka Rift Valley v. | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | NE | neprovádí se v ČR |
Junin virus | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin Hamburg, Německo | dr. J. Schmidt-Chanasit | + 49 404 281 89 42 | ANO | neprovádí se v ČR |
Krymsko-konžská hemoragická horečka v. | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | ANO | neprovádí se v ČR |
Lassa virus | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | ANO | neprovádí se v ČR |
Machupo virus | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin Hamburg, Německo | dr. J. Schmidt-Chanasit | + 49 404 281 89 42 | ANO | neprovádí se v ČR |
Marburg virus | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | ANO | neprovádí se v ČR |
Nipah-Hendra virus | Smittskyddsinstitutet Stockholm, Švédsko | dr. Andreas Brave | + 46 703 912 631 | ANO | neprovádí se v ČR |
O´nyong nyong virus | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin Hamburg, Německo | dr. J. Schmidt-Chanasit | + 49 404 281 89 42 | NE | neprovádí se v ČR |
Původce SARS | NRL pro chřipku, SZÚ-CLČ-OML | MUDr. M. Havlíčková | 267 082 400 | ANO | provádí se v ČR |
St. Louis encefalitida v. | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin Hamburg, Německo | dr. J. Schmidt-Chanasit | + 49 404 281 89 42 | NE | neprovádí se v ČR |
Venezuelská koňská horečka v. | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin Hamburg, Německo | dr. J. Schmidt-Chanasit | + 49 404 281 89 42 | NE | neprovádí se v ČR |
U pacientů s podezřením na vysoce rizikové nákazy např. mor (Yersinia pestis), pravé neštovice (Variola vera), vozhřivka (Burkholderia mallei), hemoragické horečky s vyjímkou Hantavirů provádíme ve spolupráci s FN Ostrava základní hematologická a biochemická vyšetření.
Nesrážlivá krev s EDTA: krevní obraz, laktát, hemoglobin
Nesrážlivá krev s citrátem sodným: PT (Quick), aPTT
Srážlivá krev: CRP, albumin, ALT, AST, urea, celkový bilirubin, kreatinin
klinických laboratoří
- Průkaz mikroorganizmů metodou polymerázové řetězové reakce (PCR)
- Manuál pro odběr a transport biologického materiálu v souvislosti s výskytem nového viru chřipky A (H1N1)
- Průkaz Legionella pneumophila v klinickém materiálu
- Diagnostika mykobakterií - Pokyny k odběru vzorků z prostředí
- Možnosti mikrobiologické diagnostiky dávivého kašle
- Pro gynekology: Vyšetření GBS aneb screening Streptococcus agalactiae v těhotenství
- Diagnostika hantavirových infekcí
- Vyšetření infekčnosti klíšťat
- Diagnostika urogenitálních mykoplazmat
- PCR diagnostika - průkaz RNA HEV
- PCR diagnostika – průkaz DNA leptospir
- PCR diagnostika – průkaz DNA Toxoplasma gondii
- Vyšetřování rizikových nákaz
- Stanovení shiga toxinů u kmenů Escherichia coli
- MALDI Biotyper – MBT SMART: urychlení a zkvalitnění diagnostiky mikroorganismů
- Covid-19 Antigenní test pro samoplátce
- Covid-19 PCR test pro samoplátce
- Covid-19 test protilátek
- Diagnostika viru opičích neštovic
- Urgentní (statimová) vyšetření metodou PCR
- Pokyny pro odběr na průkaz Legionella spp